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系统开发工程科研项目经费预算编制的要点提示包括以下几点：
1. 遵循“三性”原则：在编制科研项目经费预算时，应遵循目标相关性、政策相符性和经济合理性的原则。预算应紧密围绕项目目标展开，费用与项目研究活动直接相关，符合国家相关法规制度，并做到科学合理。
2. 明确项目资金来源性质：项目资金按来源分为财政资金和自筹资金。在编制预算时，需要明确各种资金来源的比例和使用规定，合规使用。自筹资金必须为单位自筹的货币资金，且应专用于该项目。
3. 了解项目资金科目归类：项目资金按科目分为直接费用和间接费用。直接费用是与科研活动直接相关的费用，如设备购置费、材料费等；间接费用则是与科研活动间接相关的费用，如管理费、绩效支出等。在编制预算时，应合理划分费用类别，各项费用得到妥善安排。
4. 精细化预算编制：在编制预算过程中，科研人员应充分考虑项目实际需求，详细列出各项费用预算。对于不擅长计算的科研人员，可以寻求单位财务人员的帮助，共同完成预算编制工作。
5. 合规性与审计准备：预算编制完成后，应进行合规性检查，各项费用符合相关法规要求。同时，做好预算执行的审计准备工作，以便在项目执行过程中随时接受审计检查。
综上所述，系统开发工程科研项目经费预算编制要点包括遵循“三性”原则、明确资金来源性质、了解资金科目归类、精细化预算编制以及合规性与审计准备。这些要点有助于科研人员合理规划项目经费，项目的顺利进行。
